Листья табака могут повреждаться микроорганизмами и вирусами в процессе вегетации. Кроме того, некоторые виды плесневых грибов поражают листья и в процессе обработки. Везде они наносят ущерб: снижают урожай и ухудшают качество готовой продукции.
Наиболее распространенными болезнями, поражающими табачные растения в период роста, являются: корневая гниль, мучнистая роса, бактериальная рябуха, пестрица, мозаичная болезнь, монтарь и др. Часть этих заболеваний вызывается грибами и бактериями, другая часть - вирусами.
Мучнистая роса - возбудитель, мицелиальный гриб, образует на листьях белый мучнистый налет. Особенно часто встречается в районах с влажным климатом и при поливном табаководстве. Меры борьбы - опыливание серой.
Бактериальная рябуха - возбудитель - бактерии, не образующие спор, названные Бактериум табакум. Микроорганизм, внедряясь в ткани листа, вызывает некроз (отмирание) тканей. На поверхности листа появляются светло-желтые, постепенно буреющие пятна. Листья табака, пораженные рябухой, относят к низшим сортам. Болезнь поражает чаще рассаду табака. Для предупреждения заболевания рассаду опрыскивают бордосской жидкостью.
Мозаичная болезнь - возбудитель - вирус. Пораженные листья имеют уродливую форму и неравномерно окрашены. Это заболевание резко снижает урожай.
Пестрица - вирус размножается в клетках ткани листьев, на поверхности их появляются мелкие белые пятна, в результате снижается качество сырья.
Монтарь - эта болезнь сильно изменяет листья, они становятся грубыми, толстыми, а при высушивании слишком хрупкими.
Самой действенной мерой против вирусных заболеваний является выведение устойчивых сортов.
В процессе сушки при нарушении технологического режима, особенно если он зависит от погодных условий, часто происходит порча листьев. Так, при медленной теневой сушке, при дождливой погоде листья табака начинают плесневеть. Плохая вентиляция сушильных помещений и повышенная влажность воздуха способствуют прорастанию спор и конидий плесневых грибов, всегда находящихся на поверхности листьев табака. Некоторые виды плесневых грибов очень нетребовательны к внешним условиям, некоторые из них могут развиваться даже при очень малой влажности табачных листьев, но при повышенной относительной влажности воздуха (85 %) в складских помещениях.
Плесневение вызывают грибы из родов Ботритис (серая гниль), Аспергиллус, Пенициллиум, Ризопус. В процессе хранения табачных листьев в тюках эти грибы могут развиваться как на поверхности, так и внутри тюка, особенно если в тюки упакованы недостаточно просушенные листья. В этих случаях микробиологические процессы в тюках наблюдаются также и при хранении их в сухих помещениях. При этом происходит самосогревание тюков, продукция портится.
В процессе ферментации недостаточно просушенных листьев также может наблюдаться плесневение. Появлению этой порчи способствует высокая относительная влажность воздуха в помещениях. В начале процесса развиваются мукоровые грибы, образуя пушистый, иногда свисающий, сероватый налет. Позднее, когда табак подсыхает и в нем накапливаются фенолы, появляются зеленые и голубые дернинки видов Аспергиллус и Пенициллиум, которые могут развиваться при меньшей влажности субстрата, кроме того, они используют для своего питания ядовитые для других грибов фенолы.
В результате плесневения внутри тюков наблюдаются сильное разогревание и повышенные потери сухого вещества, качество продукции сильно снижается.
Современные ускоренные методы и режимы ферментации при повышенных температурах (50-60 °С) и кондиционировании воздуха исключают возможность микробиологической порчи табака в процессе ферментации.
Прессованные тюки табака, прошедшего ферментацию, могут подвергнуться плесневению при хранении в условиях повышенной относительной влажности воздуха (85-90 %).
Развиваются те же плесневые грибы, что и при ферментации. Замечено, что па хорошо спрессованных тюках плесени развиваются только с поверхности, и их легко можно удалить. В слабо спрессованных тюках плесневение распространяется вглубь. В таких случаях потери значительны.
При переработке табака на табачных фабриках микробиологические процессы исключены.